Dependendo de suas configurações regionais, o Excel processará arquivos com a extensão .csv de maneira diferente. Isso ocorre porque "CSV" não tem um padrão oficial. Na maioria dos casos, ao abrir um arquivo .csv, o Excel espera vírgula ou ponto-e-vírgula como separador, nunca uma tabulação.
Ao abrir dados de texto simples (como .csv), você nunca deve apenas clicar duas vezes e esperar que o Excel adivinhe corretamente o separador, o delimitador, o encapsulamento e a codificação. Você vai quebrar seus dados.
Eu escrevi uma peça aprofundada sobre isso aqui que abrange todos os detalhes sobre os quais você realmente deve estar ciente ...
No seu caso específico, o problema não é que as linhas tenham desaparecido, o problema é que o Excel não as exibe da maneira que você espera que elas sejam exibidas. Se você abrir seu arquivo txt / csv usando um editor de texto, tenho certeza de que todos os seus dados estarão lá. A solução para o seu problema é aprender como importar arquivos csv para o Excel .