Tente:
gnome-session-quit
Para mais opções:
gnome-session-quit --help
De acordo com o manual, as seguintes opções são suportadas:
--logout
Prompt the user to confirm logout. This is the default behavior.
--power-off
Prompt the user to confirm system power off.
--reboot
Prompt the user to confirm system reboot.
--force
Ignore any inhibitors.
--no-prompt
End the session without user interaction. This only works with
--logout.
Ou, olhando para o dbus-monitor, este é o comando:
dbus-send --print-reply --dest="org.gnome.Shell" /org/gnome/SessionManager/EndSessionDialog org.gnome.SessionManager.EndSessionDialog.Open uint32:2 uint32:0 uint32:60 array:objpath:/org/gnome/SessionManager/EndSessionDialog