Até onde eu sei, as ferramentas NTFS baseadas no Linux se recusarão a tocar em um sistema de arquivos NTFS, a menos que já esteja perfeitamente consistente, para minimizar a chance de perda de dados. Você é completamente incapaz de inicializar no Windows?
Se você realmente não se importa em perder os dados, você pode deletar completamente a partição NTFS e aumentar sua partição linux para ocupar o espaço extra. Eu recomendo fazer isso de um Live CD.
Lembro-me vagamente do programa de montagem NTFS, que fornece a opção de montar um sistema de arquivos danificado como somente leitura, para que você possa recuperar dados dele, mas posso estar errado.