Finalmente descobri. CTRL + S pausa o envio de mais texto para o tty - ponto em que você pode (normalmente) fazer um CTRL + C para enviar uma SIGINT ao subprocesso para impedir sua impressão.
Dessa forma, se você estiver no vim ou no IPython, não será necessário eliminar o processo e permanecer na sua sessão.
Além disso, na extensão SqlMagic do IPython, você pode impedir que isso aconteça definindo SqlMagic.displaylimit.