Abra uma janela do Terminal e vá para / Applications. Então faça um:
ls -al
Surpresa! Todos os aplicativos são, na verdade, "diretórios / pastas". É apenas o Finder gui que mostra a maioria deles na forma de um arquivo.app em vez da pasta para simplificar (provavelmente).
(acredito que dependerá dos metadados da pasta. Alguém poderia me corrigir se eu estiver errado)
Você ainda pode acessar o conteúdo da pasta / aplicativo do Finder se clicar com o botão direito do mouse e escolher "Mostrar conteúdo do pacote".