Criptografia NTFS
The Encrypting File System (EFS) on Microsoft Windows is a feature introduced in version 3.0 of NTFS that provides filesystem-level encryption. The technology enables files to be transparently encrypted to protect confidential data from attackers with physical access to the computer.
Source: Encrypting File System
Criptografia de pastas
O Windows não criptografa realmente as pastas: quando você ativa a opção de criptografia, tudo o que você está fazendo é forçar a criptografia automática dos novos arquivos criados internamente. Citando a Wikipédia:
Folders whose contents are to be encrypted by the file system are marked with an encryption attribute. The EFS component driver treats this encryption attribute in a way that is analogous to the inheritance of file permissions in NTFS: if a folder is marked for encryption, then by default all files and subfolders that are created under the folder are also encrypted.
Source: Encrypting File System
Se você não quiser que o conteúdo da pasta fique visível, será necessário alterar a Lista de controle de acesso ( ACL) da guia Segurança das propriedades da pasta. Mesmo que outra pessoa pudesse alterar a permissão e ver os arquivos, ela não poderia abri-los de qualquer maneira.
Observação O EFS não é totalmente compatível com as edições do Windows 7 Starter, Home Basic e Home Premium.
Leitura adicional
Criptografia completa
Se você precisar de criptografia de disco verdadeira, provavelmente deverá procurar em BitLocker (disponível apenas nas edições Ultimate e Enterprise) ou uma solução de terceiros como TrueCrypt .
TrueCrypt - atualização
O site oficial do TrueCrypt agora lê:
WARNING: Using TrueCrypt is not secure as it may contain unfixed security issues
This page exists only to help migrate existing data encrypted by TrueCrypt.
The development of TrueCrypt was ended in 5/2014 after Microsoft terminated support of Windows XP.