assumindo que a barra só ocorra nas linhas que você está segmentando:
awk -F/ '{print $NF}' file
imprime apenas o último campo separado por barras. Nas linhas sem barra, o campo 1 também é o último campo.
Se você estiver segmentando especificamente as linhas que começam com hsa-miR
, então:
awk -F/ '/^hsa-miR/ {print $NF; next} {print}' file