Você não pode aumentar a lista MRU (Most Recently Used) após 26 entradas porque o Windows usa uma letra para registrá-las no registro, e o idioma inglês tem apenas 26 letras. :)
Quanto a um substituto, embora as recomendações de produto sejam geralmente fora do tópico, aqui está um par que você pode conferir por si mesmo para ver se elas se encaixam na fatura (nunca usada pessoalmente):
SlickRun is a free floating command line utility for Windows.
This is a multi purpose launcher and a more advanced and customizable version of Windows' run.