Se você tiver algum plug-in instalado em seu Eclipse, seja no Eclipse Marketplace ou em outras fontes, há uma chance de que você quebre um plug-in ou perca a funcionalidade de um plug-in se você fizer upgrade de seu Eclipse. Quando você faz upgrade do Eclipse, o Eclipse não verifica se a funcionalidade completa de todos os seus plug-ins será preservada. Então você terá que descobrir mais sobre um plug-in que não está funcionando da maneira mais difícil depois que você descobrir que seu código não está funcionando como esperado. Portanto, seria melhor se você fizesse backup de todos os dados do seu projeto e fizesse uma nova instalação da última versão do Eclipse.