Isso certamente não danificará o disco rígido.
No que diz respeito aos seus documentos: eles foram armazenados na sessão atual (na RAM), portanto, não importa se os arquivos no disco foram alterados; o arquivo de hiber ainda terá uma cópia dos arquivos à medida que você for embora eles.
Se desejar, você pode salvá-los no disco rígido (ou não, se preferir manter a versão que você colocou no disco rígido quando foi removida).
Inicialize com o disco, e você verá tudo da mesma forma que você o deixou. A única vez que você teria alguma coisa para se preocupar é se você apagou ou corrompeu o arquivo de hibernação, o que não aconteceu desta vez pelos sons dele.