A partir daqui: link
Os arquivos de configurações da Internet estão em uma classe própria. Esses arquivos podem ser colocados em sua Intranet Corporativa, podem ser colocados na pasta SIGNUP de qualquer instalação do Internet Explorer e podem ser alimentados no Internet Explorer usando
rundll32.exe iedkcs32.dll,BrandInternetExplorer /ins:<Ins file location>
Então, basicamente, coloque o arquivo em uma pasta de rede compartilhada e use um script de logon para disparar o comando acima