Tentou desconectar o cabo até que a VPN volte?
Em qualquer caso, você pode excluir todas as conexões com / sem fio que o Network Manager armazenou e deixar as VPNs lá com a opção "automática" ativada para que, quando a VPN voltar, ela se conecte automaticamente.
Só para deixar meu ponto um pouco mais claro. Em Com fio, Sem fio, Banda larga móvel e DSL, defina todas as conexões que você possa ter lá para não serem automáticas (remova a seleção Conectar automaticamente da caixa de seleção). Ou, para ser mais drástico, remover completamente a conexão. O único que deve estar em Conectar Automaticamente é a conexão VPN que você possui.
Com isso, você deve ter um sistema que se conecte automaticamente à VPN quando ela estiver disponível. Quando se desconecta, o sistema fica offline até que a VPN volte.