Se estas são janelas de terminal, você pode querer reinstalar libgtk2-perl , já que o frontend do gnome para o debconf depende dele.
Quando eu instalo um programa do gerenciador de software, eu tenho muitas janelas em branco debconf abrindo e desaparecendo.
Esse comportamento é normal ou devo relatar um bug?
Se estas são janelas de terminal, você pode querer reinstalar libgtk2-perl , já que o frontend do gnome para o debconf depende dele.
Tags xfce software-center debconf