O procedimento para instalar um sistema operacional no Virtual Box é praticamente idêntico ao da instalação em hardware real. Você ainda precisa particionar o disco virtual como se fosse um disco físico (como descrito no guia de instalação do Gentoo) com fdisk (ou o que você preferir). É melhor usar o CD mínimo do Gentoo, mas a partir de qualquer outro ambiente Linux também funcionará, desde que todas as ferramentas necessárias estejam disponíveis. Você pode instalar o fdisk (na RAM) com seu DVD ao vivo atual usando o procedimento de instalação do pacote de distribuição, se não estiver incluído.
Você não precisa instalar a versão amd64 do Gentoo, a versão x86 também funcionará. Mas observe que a versão amd64 pode fornecer um ambiente híbrido capaz de executar binários de 32 bits.