Você pode usar c-set-style
e amigos para alterar o estilo geral de recuo desejado. Você também pode alterar partes individuais do mecanismo de recuo para obter algo muito personalizado. Veja a página do EmacsWiki para detalhes. O que você provavelmente quer (para uma primeira aproximação) é simplesmente
(c-set-style "bsd")
em um gancho ou
(setq c-default-style "bsd")
no seu .emacs
.