Após algumas pesquisas, descobri que os arquivos TGA não possuem metadados, de modo que eu possa usar um fc simples para compará-los. No entanto, fc é realmente lento se houver muitas diferenças, então eu fiz algumas pesquisas e encontrei o FCMP ( link ) que faz exatamente o que eu preciso, de graça.
Eu também posso usar outro programa de linha de comando para mudar de outros formatos para TGA, para que funcione bem também.
Obrigado aos outros que tentaram ajudar!