Is there any way to repair the installer executable and run it?
Não.
Pelo menos não sem muito mais esforço do que obter um instalador limpo de outro lugar.
Do you think the virus has infected my PC?
Parece que o CS_INSTALL é um arquivo em lote e não foi executado. Mas veja Como posso remover spyware, malware, adware, vírus, trojans ou rootkits mal-intencionados do meu PC?