O conversor de RTF no OpenOffice.org não preserva comentários.
Tente salvar como .doc em vez de RTF para ver se há um resultado melhor. Esse conversor tende a estar em melhor forma.
A última versão estável do OpenOffice.org é a 3.3.0. Se você não tem isso, vá diretamente para link para o download.
Você pode conseguir superar esse problema instalando também o LibreOffice, link . O LibreOffice 3.4.3 pode converter melhor em alguns casos. Ele não substituirá sua configuração do OpenOffice.org e você poderá alternar entre as etapas úteis.