Enquanto os monitores forem controlados com uma resolução e uma taxa de atualização que estejam dentro de suas especificações, não haverá problemas.
Por exemplo, atualmente estou dirigindo dois monitores com uma tela esticada em 2560x1024 @ 60Hz e um monitor CRT separado em 1024x768 @ 70Hz
EDIT: perdeu o bit importante, todos os meus monitores estão usando vga / adaptadores