Na prática, NÃO.
Teoricamente, em algumas circunstâncias, sim. Com base na velocidade do disco que passa abaixo das cabeças de leitura / gravação e na distância que devem percorrer.
Uma coisa é porque você diminuiu o tamanho da partição de disco disponível para o sistema operacional, tem menos distância para viajar. Assim, as buscas devem ser mais rápidas do que se todo o 1TB estivesse disponível para qualquer sistema operacional.
Em termos de corridas do dia-a-dia, você não será capaz de dizer qualquer diferença, a menos que tenha feito isso antes de & após o teste usando o software de teste de desempenho de disco.
Mas há tantos fatores diferentes envolvidos que determinam o desempenho, incluindo o tipo de sistema de arquivos, o tamanho do setor, o tamanho dos arquivos que estão sendo lidos, o nível de fragmentação (e a lista continua) que não foi possível generalizá-lo.
Eu diria, não se preocupe com isso. Faça o que você planeja e tudo ficará bem.