Também tive esse problema (SSMS 2008 R2, Win 7 de 64 bits, 3 telas, NVIDIA Quadro NVS 420).
A solução que resolveu o problema para mim foi alterar as 'Compatibility Settings' para o Ssms.exe. Verifique a configuração: 'Desativar o dimensionamento de exibição em configurações de DPI alto'.
Na próxima vez que o SSMS for aberto, não haverá mais erros de rolagem irritantes.