SATA é " IDE ", bem, mais ou menos. ;)
Você não está usando dispositivos PATA, por isso é difícil dizer se eles significam 'PATA' da IDE.
Portanto, sem conhecer os detalhes específicos da sua placa-mãe e uma pequena experiência com a configuração do BIOS em questão, essas opções são um pouco vagas. Qualquer um deles poderia e, provavelmente, afetaria suas unidades SATA.
Você pode apostar melhor para configurá-los para corresponder às especificações das unidades para que você não precise esperar pela detecção automática.
Mas, na verdade, o tempo de inicialização que você economizará desabilitando essas opções provavelmente será insignificante na BIOS de hoje, e IMO é mais difícil de manter com o tempo do que vale a pena, então Auto é seu amigo. :)