Como apontado pelo Hyperperforator, sua comparação entre os tempos de inicialização do Windows e do Linux é irrelevante. No entanto, o uso da CPU parece anormal no Linux. Em uma instalação sã, o Linux geralmente deve ser mais responsivo do que o windows, tanto quanto eu pude julgar, e você não deve ter um uso constante de 20% da CPU quando ocioso. Você poderia postar mais algumas informações sobre o estado do seu sistema? Quais processos estão sendo executados? Precisamos de mais informações para ajudar.
P.S .: 1,4 GB O uso de RAM apenas para o SO é muito grande para uma instalação do Linux. Parece mais um indício de que algo está errado com o seu sistema.