-a
é equivalente a -dpr
, o que significa copiar links simbólicos literalmente (em vez de seus destinos), modo de preservação, propriedade e registros de data e hora e recursor (subdiretórios de cópia)
-pr
seguiria links simbólicos e copiaria seus alvos, em vez de copiar fisicamente o link simbólico. Ele ainda preservaria o modo, a propriedade e os registros de data e hora e ainda o reciclaria.
man cp
dirá tudo o que você precisa saber.