Nunca tendo usado o MediaMonkey, eu não tenho uma resposta definitiva para a questão de se isso pode ser feito sem ter que baixar o iTunes em primeiro lugar. Mas, pelo que pude encontrar, se você está pronto para assinar o podcast no iTunes, então ...
Use iTunes File -> Export and save the OPML file.
Use MM3 Edit -> Podcasts -> Add Directory(OPML) to import the saved file. This should create a new "iTunes Subscribed Feeds" entry in the Podcast Subscriptions -> Podcast Directories tree node.