Sim, desde que o Live CD que você usa tenha um software capaz de localizar e remover qualquer malware específico detectado, verifique se você tem arquivos de definição de vírus atualizados, por exemplo.
Ou você pode inicializar em um CD ao vivo e fazer o download de algo, enquanto está em execução (mas obviamente teria que baixar novamente toda vez que inicializar). Ou obtenha qualquer CD antigo ao vivo e verifique se você tem todos os recursos AV necessários em um pendrive.
Veja as perguntas que relacionei abaixo, que investigam um tema semelhante e têm várias sugestões que, acredito, podem fornecer uma resposta útil para você:
Live CD com bom anti-vírus software para digitalizar / reparar o Windows?