Eu comecei a experimentar o problema com outros aplicativos mais tarde, e então comecei a procurar por solução não para o Nemo, mas em geral, e encontrei um no Fóruns do Ubuntu e dois em Ask Ubuntu como bem.
Isso é causado pelo Compiz, então você tem que usar compizconfig-settings-manager
( sudo apt-get install compizconfig-settings-manager
, então iniciar o comando ccsm
com Alt + F2, ou do terminal, ou procurar por "CompizConfig Settings Manager" no painel).
- Abra "Opções gerais"
- Na guia "Foco e aumento de comportamento", defina o Nível de prevenção de foco como Desativado
Depois de seguir estas etapas, todas as minhas janelas recém-abertas aparecem em primeiro plano como esperado.