1) Os cabos Molex são usados pelos fãs em muitos casos.
3) Muitas placas gráficas mais novas exigem esses cabos PCI-e. Ainda estou para ver qualquer outro hardware que os use, mas acredito que eles sejam compatíveis apenas com o hardware PCI-e que os suportam expressamente.
4) Algumas placas-mãe exigem que elas alimentem a CPU.
5) Isso tem o mesmo propósito. Placas-mãe mais novas usarão isso em oposição ao fio ATX 12v de 4 pinos.
Se você não tem para onde conectar estes cabos, não se preocupe com eles - se não houver um buraco para isso, a placa-mãe não precisa disso.