Depende de qual ambiente de área de trabalho você está usando, mas procure nas preferências do mouse por uma configuração para "emular três botões de mouse". Eu acredito que você deveria desligar isso.
Estou executando o Virtualbox no Windows Vista. Eu tenho um mouse USB da Microsoft (ele diz "Comfort Optical Mouse 3000") com botões esquerdo e direito, e uma roda do mouse no meio. Se eu pressionar a roda, é óbvio que faz um "clique".
Estou usando o Debian dentro do Virtualbox, e está funcionando muito bem, mas o clique do meio do mouse não faz nada. Clique com o botão esquerdo e direito, e rolando com a roda, funcione bem.
Existe alguma maneira de fazer o clique do mouse do meio funcionar na minha máquina virtual?
Depende de qual ambiente de área de trabalho você está usando, mas procure nas preferências do mouse por uma configuração para "emular três botões de mouse". Eu acredito que você deveria desligar isso.
Pode ser um problema de configuração no host, especialmente se você tiver o software MS Intellipoint instalado. Experimente as configurações do mouse no Painel de Controle.