Por que a unidade lógica seria excluída se você reinstalar?
Uma partição lógica (estendida) é apenas um tipo especial de partição primária que é usada para incluir outras partições, a fim de superar o 4 limite de partição primária e é uma partição própria por si só, o que significa que a exclusão do Windows (em outra partição) não terá efeito sobre a partição estendida.
A menos que eu esteja sentindo falta de algo e você esteja usando Dynamic Disks , nesse caso, há informações mistas sobre como é fácil convertem de volta para um sistema de disco básico .