Ele não invalida a serial do Vista, apenas atualiza o sistema operacional. Você pode reinstalar o Vista mais tarde, se desejar.
Observe que a chave de produto de atualização do Win 7 só funcionará como uma atualização. Você não pode fazer uma nova instalação com um disco de atualização sem ter a mídia física para uma versão qualificada do Windows. Se você tem um desses grandes conjuntos de recuperação, como a Sony é notório por fazer, ou se você tem uma recuperação de disco rígido embutida, como a Dell tem e não surgiu para a mídia real, você não pode fazer uma instalação limpa.
Com o Vista (e suponho que isso também se aplica a 7), você pode instalar o Vista sem colocar uma chave de produto, permitindo uma nova instalação. Em seguida, faça uma atualização in-loco do Vista novo para o novo Vista. Isto lhe dará uma instalação limpa do Vista sem ter mídia prévia disponível.