Isto é, porque a pasta / etx / X11 e todo o seu conteúdo são de propriedade de root. Ao alterar steeings, um backup do xorg.conf deve ser criado e seu usuário atual não tem direitos para fazê-lo. Tente executar isso como um superusuário, assim:
sudo nvidia-settings
EDITAR:
No Gnome você deve usar
gksudo nvidia-settings
No KDE você deve usar
kdesudo nvidia-settings