"My 3TB is drive is NTFS, and my 6TB is exFAT, but I don't tink that it matters"
Sim, é importante.
Seu tamanho de alocação é crítico aqui. Mude o seu sistema de arquivos para NTFS ou exFat, ambos precisam corresponder. Ou defina o tamanho da unidade o menor possível. Eu suspeito que você deixou as configurações no padrão. Caso contrário, cada arquivo, mesmo o menor arquivo (por exemplo, 1kb) será transferido 4096KB. Se você fizesse as contas, teria a quantidade de shows mostrada no seu relatório de log.
Em conclusão, a solução mais fácil é combinar o formato do sistema de arquivos. Ambos NTFS ou ambos exFAT.