As regras são correspondidas em ordem. Faça um para permitir o localhost à frente do que negar.
iptables -A ENTRADA -p tcp -s localhost -m tcp -m multiporta! --dports 22,80,443 -j ACCEPT
iptables -A ENTRADA -p tcp -m tcp -m multiporta! --desportos 22,80,443 -j DROP
Leia aqui como salvá-los, dependendo do seu sistema operacional. link