Geralmente, não é seguro eliminar um processo que faz manipulação de baixo nível. No seu caso, você tem uma rede de segurança, já que a outra unidade está funcionando.
Supondo que esses dois volumes estejam configurados como RAID 1, você pode desmontar o que funciona (apenas para segurança extra), matar o processo xfs_repair e avaliar o estado do que foi interrompido, depois restaurar o bom ( desmontado anteriormente) se não estiver funcionando.
Dado que o processo está a 0% de uso, provavelmente está em deadlock, o que significa que deve ser eliminado e esse seria o caso mesmo se fosse seguro ou não. Um desligamento ou reinicialização implicitamente o mataria de qualquer maneira, então eu sugiro que você vá em frente e faça você mesmo, então tenha mais controle sobre o que está acontecendo. Se alguma coisa ruim acontece, provavelmente já aconteceu ou foi inevitável.