Sim e não, depende de como o dispositivo é limitado.
Se o dispositivo tiver uma limitação de hardware que o limite a um determinado tamanho, não será possível contornar isso formatando, pois isso não altera as características físicas do cartão.
Se o dispositivo tiver um limite de software que limite o tamanho máximo do sistema de arquivos, você criará uma partição (com a ferramenta de particionamento escolhida) um pouco menor que o tamanho máximo e formatará o sistema de arquivos exigido pelo dispositivo.
Ter o próprio dispositivo fazendo a formatação normalmente não funcionará, pois ele tentará usar o cartão inteiro nesse caso, o que é muito grande.