Eu estava tendo o mesmo problema.
O script para abrir o monodevelop precisava de um programa chamado realpath
que eu não tinha, então;
sudo apt-get install realpath
Especialistas: existem métodos alternativos para instalar o caminho real;)
Além disso, você pode querer verificar novamente se o Unity3D possui o caminho correto para o monodevelop;
- Abra o Unity3D, nos menus, vá para
Edit > Preferences
- Vá para a guia "Ferramentas externas"
- Abra o menu suspenso
External Script Editor
e selecione brwose
(abaixo)
Dependendo de onde você tenha o monodevelop instalado, você deve selecionar o script chamado "monodevelop".
Eu tinha o monodevelop instalado com o Unity3D.
Encontre a pasta monodevelop e selecione MonoDevelop/bin/monodevelop