Acabei de ter o mesmo problema e resolvi isso abrindo um terminal com Ctrl + Alt + T e digitando estes comandos:
unity-tweak-tool --reset-unity
dconf reset -f /org/compiz/
setsid unity
Isso fará com que a ferramenta de ajuste de unidade redefina todas as configurações para o valor padrão, redefina a configuração do compiz e, finalmente, reinicie a unidade.