Eu acho que você pode ter fritado sua placa-mãe. Você provavelmente usou composto térmico à base de prata, que é eletricamente condutivo porque tem metal nele. Quando ele se derramou sobre a tampa, ele pode ter ficado embaixo da CPU de alguma forma e encurtado alguns pinos, embora você tenha dito que nenhum deles estava na placa-mãe, então é uma espécie de adivinhação.
Mesmo se você usasse composto à base de silicone (que não é eletricamente condutivo), você deve estar ciente de que a aplicação excessiva do composto térmico é quase tão ruim quanto não usar nenhum. O trabalho do composto é preencher os poros microscópicos nas duas superfícies de metal para eliminar vazios de ar entre eles. O composto em si é um condutor térmico melhor que o ar, mas não tão bom quanto o dissipador de calor de metal sólido. Em vez de apenas preencher lacunas, o uso de muita pasta cria uma barreira de transferência de calor menor do que a ideal entre os dois metais. Torna-se um isolante nesse ponto, que é exatamente o oposto do que você quer. O fato de o composto ter saído pelos lados do dissipador de calor significa que você provavelmente usou demais.
Uma CPU recebe muito HOT muito rapidamente (estamos falando de milissegundos). É possível que você tenha assado o tabuleiro.