O Ubuntu tentará principalmente formatar seu SO sob uma partição ext4 . Isso é não suportado no Windows e, portanto, você não pode acessá-los.
Há uma variedade de ferramentas de terceiros disponíveis, como a Mini-ferramenta , que ajudará você a concluir esta tarefa no Windows.
Pessoalmente, eu acho que a opção mais fácil é usar um Live Linux USB para formatar a unidade do Linux.