Você pode colocar a chamada do script em /etc/rc.local
.
Este arquivo será executado na inicialização, portanto, coloque o comando que você deseja executar no final do arquivo e ele será chamado na inicialização.
Outra maneira é criar um script de inicialização LSB e colocá-lo em /etc/init.d
. Esses scripts têm que seguir algumas regras para serem considerados compatíveis com LSB. Depois de adicioná-lo a este diretório, basta ativá-lo com update-rc.d yourscript defaults
.