Pelo que entendi, Storage Spaces é um RAID de software. Você precisa que o Windows já esteja em execução para que ele funcione e crie uma letra de unidade exclusiva.
Você precisa do RAID de hardware ou de uma configuração mais complicada (ou de um software de criptografia mais inteligente): Não tenho certeza de que isso é possível com o Windows e com Truecrypt .
Dito isso, Truecrypt está obsoleto ( fonte ):
WARNING: Using TrueCrypt is not secure as it may contain unfixed security issues
This page exists only to help migrate existing data encrypted by TrueCrypt.
The development of TrueCrypt was ended in 5/2014 after Microsoft terminated support of Windows XP. Windows 8/7/Vista and later offer integrated support for encrypted disks and virtual disk images. Such integrated support is also available on other platforms (click here for more information). You should migrate any data encrypted by TrueCrypt to encrypted disks or virtual disk images supported on your platform.
Então, você deve considerar usar outra coisa como bitlocker , que permite fazer exatamente isso.
Editar:
Desculpe, não entendi que esses discos não estavam contendo o Windows ... Então, basta reinstalar Truecrypt e declarar novamente a configuração com Space Storages . Você deve ser capaz de lê-los como costumava fazer. No entanto, meu comentário sobre Truecrypt ainda é verdadeiro. :)
Edit2:
Como alternativa (e maneira mais segura de fazê-lo), você pode remover um dos discos do pool, formatá-lo, copiar arquivos do disco 1 para o disco 2, reinstalar o Windows e configurar o RAID novamente com SS + TC (ou bitlocker ).