A maioria dos SSDs vem com software feito especificamente para o seu caso de uso. Eu posso dizer por experiência que os softwares da Samsung e da Intel fornecidos com o trabalho do SSD estão incrivelmente bem e não exigem nenhuma configuração ou configuração adicional.
Se você não está comprando uma dessas marcas que NÃO fornecem o software, há uma infinidade de ótimas ferramentas de clonagem, incluindo o CloneZilla, como você mencionou. Tudo isso vai funcionar bem.
Dito isto, não faria mal em garantir que os drivers da sua placa-mãe (ou placa SATA, se você estiver usando um dedicado) estejam totalmente atualizados, assim como as atualizações do Windows.
Se você quiser testar se o SSD está funcionando ea que velocidade, CrystalDiskMark é um recurso muito popular ferramenta para tal.
Então, resumindo, não há mais nenhuma configuração necessária depois de clonada