I've been trying to do some three monitor gaming and technologies such as Eyefinity and Intel Collage Display, but it seems that they are only applied to the monitors connected to the card
Verdadeiro. Para usar o eyefinity você precisaria conectar todos os monitores na configuração do eyefinity para a (s) placa (s) AMD. Tanto quanto sei, isso também é verdade para a GPU Intel.
No entanto, existem softwares que podem combinar diferentes GPUs (mesmo entre marcas) e apresentar uma GPU ao sistema. (Veja Lucid Virtu ). Eu não descobri se essa 'GPU virtual' suporta a funcionalidade eyefinity. Então, o melhor que posso oferecer é um 'talvez' para sua configuração atual.
No entanto, por que não simplesmente conectar todos os três monitores à placa AMD e usar o eyefinity? Na minha experiência, isso funciona muito bem e é provavelmente mais estável do que rodar um jogo em diferentes GPUs de marca / modelo.