Este link mostra que o PPA
contém o pacote gephi para apenas os precisos e onerosos. Assim, siga os passos abaixo para instalar o gephi no Ubuntu 13.10.
sudo add-apt-repository ppa:rockclimb/gephi-daily
Depois de adicionar o repositório acima, execute o comando abaixo
gksu gedit /etc/apt/sources.list.d/rockclimb-gephi-daily-saucy.list
Substitua a palavra saucy para precise e salve-a.
sudo apt-get update
Agora instale gephi executando,
sudo apt-get install gephi