Tenho certeza de que o motivo de o problema ter desaparecido é que no início você não estava usando duas instâncias de MSVS; em vez disso, você arrastou uma subjanela acoplável para fora do original, criando dois janelas separadas. Quando eu tento usar alt tab para alternar entre estes, não me deixa (enfurecendo!).
No entanto, se eu iniciar duas instâncias reais (usando o atalho do MSVS duas vezes, por exemplo), posso alternar usando a guia alt.
Se você, ou qualquer outra pessoa, souber como resolver o problema anterior, adoraria saber!