Para usar xsetwacom para fazer isso, olhe aqui: link
Você basicamente precisa fazer isso manualmente, calculando as proporções do seu monitor e traduzindo-as para o tamanho do tablet. A instrução no link explica como mapear o tablet inteiro para a tela, com distorção. Deve ser fácil (se você pegar a matemática por trás) para adaptá-lo para não distorcer.
MAS também existem aplicações gráficas: link
Se você está no KDE, talvez queira dar uma olhada no módulo de configurações "Wacom tablet". Ainda não é onde está o driver do Windows, mas permite que você faça o que quiser, defina perfis diferentes e muito mais. Devo dizer que não está funcionando bem para mim no Debian Jessy, mas a versão no repositório é bem antiga. (Você não diz qual distro você está usando, geralmente relevante em uma questão de linux)
Há também um applet do GNOME, nunca tentei, mas parece bom (melhor ainda?).