Não deve haver armadilhas a menos que o seu driver gráfico o ligue acidentalmente para aplicativos que de alguma forma trabalham com nossa GPU com tanta força que ela fica abaixo da taxa de atualização do seu monitor.
Ativar o vSync a partir do painel de controle do driver de vídeo (painel de controle nVIDIA ou AMD Catalyst, eu só falo sobre esses 2) irá forçá-lo apenas em aplicativos dependentes do OpenGL, por isso não ajudará na maioria dos jogos modernos (que geralmente usam apenas o Direct3D). Tanto a nVIDIA quanto a AMD não permitem forçar o vSync em aplicativos Direct3D, eles afirmam que é necessário ativar o vSync no menu dos respectivos jogos.
Aplicativos como o Adobe Photoshop IIRC usam o OpenGL para sua aceleração de GPU, mas não sei se o vSync irá prejudicar sua capacidade. Considerando que mesmo a GPU low-end é normalmente capaz de renderizar superfícies 2D com taxas de quadros impressionantes (e irá desativar o nível mais alto de aceleração da GPU), eu não acho que o vSync será um problema lá.
No entanto, como eu disse, a maioria dos jogos modernos usa o Direct3D em vez do OpenGL, então forçar o vSync globalmente não é uma boa idéia de qualquer maneira.