Se o seu SQL Server ainda estiver em execução, ele manterá uma reserva nos arquivos. Você precisaria parar o SQL Server antes que o synctoy pudesse copiar esses arquivos.
Também vale notar que, mesmo que o synctoy estivesse copiando os arquivos do banco de dados do sql server, provavelmente não estaria fornecendo um backup utilizável.
Se você deseja fazer backup de um banco de dados do SQL Server, execute um agendamento de backup no Gerenciador do SQL Server e copie apenas os arquivos de backup. Não use synctoy diretamente nos arquivos de banco de dados do servidor SQL