O SuperPuTTY suporta um recurso chamado layouts, isso permite que você abra suas sessões e organize sua tela como preferir. Você pode então clicar em Arquivo - > Salvar layout (CTRL + S), se você tiver sua janela de layouts aberta (Exibir - > Layouts), você pode clicar duas vezes no layout salvo e ele abrirá todas as sessões que você abriu anteriormente em seu layout.